● 馬偕腳蹤健走活動
2012年為馬偕博士登陸140週年及慶祝馬偕紀念醫院遷址雙連現址100週年，醫院於3月11日舉行「第二屆佳美腳蹤」健走活動，共有2500位員工及眷屬參加，活動從捷運淡水線淡水站後方廣場集合出發至馬偕博士登陸處合照後至真理大學大禮拜堂感恩禮拜，途中經滬尾偕醫館、淡水長老教會、馬偕博士租屋發跡地、淡江中學八角塔、婦學堂、馬偕故居、牛津學堂等，並至馬偕墓園獻花及合唱「最後的住家」，讓員工及家屬感念馬偕博士當年蓽路藍縷的辛勞及認識淡水之美。
楊育正院長致詞時表示感謝所有馬偕人盡心盡力於醫療傳道的辛勞，更感謝所有馬偕人家屬多年來支持家人在醫院工作而擔誤家庭的包容，充份展現出馬偕不分上下彼此，全是在主內的一家人。
除了健行活動，當日另舉辦攝影比賽讓員工記錄活動的點點滴滴，並藉由此次攝影比賽將馬偕博士及所創立馬偕紀念醫院奉獻台灣這塊土地做一美好的見證。
● 「鬍鬚番」傳奇動畫與漫畫
配合2012年紀念活動，為宣揚馬偕博士對台灣的付出與貢獻，特發行「黑鬚番傳奇─馬偕博士動畫傳記DVD」，透過動畫的生動詮釋，經典重現台灣早期醫療概況及馬偕博士抵台傳福音的精神與事蹟，期望以淺顯易懂的形式讓更多台灣人及下一代，共同紀念將生命奉獻在台灣的馬偕博士。
本次動畫主題曲感謝蔣渭水文化基金會授權使用何嘉駒老師譜曲、馬偕博士詩作填詞的「最後的住家」，並由福爾摩沙合唱團演繹，以動人旋律完整傳遞馬偕博士對台灣最深切的愛。
而動畫配音的國、台語版本則邀請藝人樊光耀、宋逸民獻聲，分別飾演馬偕博士及馬偕博士的首位台灣門徒嚴清華。 11月12日下午在馬偕紀念醫院舉行的「黑鬚番傳奇」首映會中，多位牧者均蒞臨支持，而在首映記者會中，由楊育正院長率施壽全副院長、劉建良副院長、張文信副院長及院牧部牧師，將象徵七原罪的牙齒拔除換上七美德，以象徵馬偕博士當年以拔牙為民眾解除痛苦的善行。這次馬偕博士動畫傳記之販售所得，扣除成本後將全數捐出響應急重症醫療大樓籌建計畫，也藉此再次呼籲大眾關注台東鄉親就醫品質，幫助台東民眾安心享有最完善的醫療照顧。
● 感恩音樂禮拜與音樂會
紀念馬偕來台140週年暨本院遷址雙連一百週年，12/26晚上七點30分將於本院大禮堂將舉行感恩禮拜暨音樂會，擬邀請台北及淡水院區聖歌隊及八角塔男生合唱團獻唱；並有台南神學院音樂系系主任管風琴獨奏；陽光台北青年管弦樂團演奏及〝評鑑男聲重唱團〞演出。邀請函及海報將於12月6日前將寄至各教會、教會機構及附近社區，歡迎牧長、會友及民眾共襄盛舉。
當晚活動第一部份為音樂崇拜，主題為-「祂的慈愛永遠長存」，內容以詩班讚美及會眾交互啟應為主，啟應文由院牧部牧師編寫，分為三個部分，為過去感謝上帝的保守、為現在祈求上帝的帶領、為未來祈求上帝的賜福。
啟應的間隔部分，將由台北院區聖歌隊、淡水院區聖歌隊及八角塔男生合唱團獻詩，最後，回應詩 -「主阿，我在此」將以聖歌隊與會眾交互唱和的方式進行，並由吳再成前院長令媛譜曲，讓青年管弦樂團扮奏，一起回應、頌讚上帝的慈愛。
第二部份音樂會，除管風琴獨奏、陽光台北青年管弦樂團演奏，並將演唱蕭泰然老師作品「啊~福爾摩沙 鎮魂曲選曲」之第二樂章：記憶與感念及第四樂章：美麗的國度；合唱團成員由馬偕同仁及院外有好人士組成。
